Банк России приравнял с 1 января 2016 г. значение ставки рефинансирования к значению ключевой ставки Банка России, определенному на соответствующую дату (Указание Банка России от 11.12.2015 N 3894-У).
Решение ЦБ РФ уравнять ставки повлияло на формирование налоговых обязательств перед бюджетом, перед работниками организаций, а также на другие суммы, выплата которых связана с нарушением норм НК РФ как налогоплательщиком, так и налоговым органом.

Напомним, что в декабре 2015 г. ставка рефинансирования составляла 8,25%, а ключевая ставка - 11% .  Следовательно, после уравнивания этих ставок с 2016 г. автоматически вырастают суммы платежей, которые зависят от ставки рефинансирования.

Ниже рассмотрим, в каких расчетах по налогам и взносам бухгалтер может столкнуться со ставкой рефинансирования.

Участвует ставка рефинансирования в расчете в целях исчисления НДФЛ:
- с материальной выгоды, предусмотренной в пп. 1 п. 1 ст. 212 НК РФ (пп. 1 п. 2 данной статьи);
- с налоговой базы по договорам добровольного страхования жизни, предусмотренным пп. 2 п. 1 ст. 213 НК РФ;
- с суммы процентов, уплаченных налогоплательщиком по кредитам и займам, полученным для совершения сделок с ценными бумагами (пп. 11 п. 10 ст. 214.1 НК РФ);
- с доходов в виде процентов, получаемых по вкладам физических лиц в банках, находящихся на территории РФ (ст. 214.2 НК РФ);
- с доходов в виде платы за использование денежных средств членов кредитного потребительского кооператива (пайщиков), процентов за использование сельскохозяйственным кредитным потребительским кооперативом средств, привлекаемых в форме займов от членов сельскохозяйственного кредитного потребительского кооператива или ассоциированных членов сельскохозяйственного кредитного потребительского кооператива (ст. 214.2.1 НК РФ);
- при определении налоговой базы по операциям РЕПО (ст. ст. 214.3 и 214.4 НК РФ);
- при возврате налоговым агентом налогоплательщику излишне удержанной суммы НДФЛ с нарушением срока, предусмотренного п. 1 ст. 231 НК РФ;
- при расчете минимального размера денежной компенсации, подлежащей выплате работнику за нарушение установленного срока оплаты труда  (ст. 236 ТК РФ).

Подобные нормы, связанные с расчетами, установленными исходя из ставки рефинансирования Банка России, есть, например, и в Федеральном законе от 24.07.2009 N 212-ФЗ «О страховых взносах в Пенсионный фонд Российской Федерации, Фонд социального страхования Российской Федерации, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования».

Используется ставка рефинансирования и непосредственно при расчете налогов. Так, согласно пп. 3 п. 1 ст. 162 НК РФ налоговая база по НДС увеличивается на суммы полученных в виде процента (дисконта) по полученным в счет платы за реализованные товары (работы, услуги) облигациям и векселям, процента по товарному кредиту в части, превышающей размер процента, рассчитанного в соответствии со ставками рефинансирования Банка России, действовавшими в периодах, за которые производится расчет процента.

Кроме того, согласно п. 4 ст. 75 НК РФ процентная ставка пени, которая является одним из способов обеспечения исполнения обязанности по уплате налогов и сборов, принимается равной 1/300 действующей в период просрочки их уплаты ставки рефинансирования Банка России.

При предоставлении отсрочки или рассрочки по уплате налога в соответствии со ст. 64 НК РФ в определенных случаях на сумму задолженности начисляются проценты исходя из ставки, равной 1/2 ставки рефинансирования.

Эти случаи перечислены в пп. 3, 4 и 5 п. 2 указанной статьи:
- если есть угроза возникновения признаков несостоятельности (банкротства) заинтересованного лица в случае единовременной уплаты им налога;
- имущественное положение физического лица (без учета имущества, на которое в соответствии с законодательством РФ не может быть обращено взыскание) исключает возможность единовременной уплаты налога;
- производство и (или) реализация товаров, работ или услуг заинтересованным лицом носят сезонный характер.
Данный показатель является регулятором при предоставлении и пользовании инвестиционным кредитом согласно ст. ст. 66 - 68 НК РФ.
В то же время повышение ставки рефинансирования окажется в пользу налогоплательщика, которому налоговый орган:
- выплачивает проценты в связи с неправомерным вынесением решения о приостановлении операций по расчетному счету налогоплательщика (абз. 3 п. 9.2 ст. 76 НК РФ);
- возвращает сумму излишне уплаченного или излишне взысканного налога с нарушением установленных сроков (п. 10 ст. 78, п. 5 ст. 79 НК РФ);
- направляет уведомления о возможности симметричных корректировок по контролируемым сделкам (п. 5 ст. 105.18 НК РФ);
- возвращает суммы НДС после завершения камеральной налоговой проверки, по итогам которой было вынесено решение о возмещении (полном или частичном) суммы налога, с нарушением сроков, предусмотренных п. 10 ст. 176 и п. 10 ст. 176.1 НК РФ (аналогично в отношении акцизов согласно п. 7 ст. 203.1 НК РФ).

Но в соответствии с п. 17 ст. 176.1 НК РФ, если сумма налога, возмещенная налогоплательщику в заявительном порядке, превышает сумму налога, подлежащую возмещению по результатам камеральной налоговой проверки, налоговый орган принимает решение о возврате в бюджет излишне полученных налогоплательщиком (зачтенных ему) в заявительном порядке сумм исходя из процентной ставки, равной двукратной ставке рефинансирования Банка России, действовавшей в период пользования бюджетными средствами (аналогично в отношении акцизов на основании п. 14 ст. 203.1 НК РФ).

Согласно ст. 133 НК РФ с банка можно взыскать штраф в случае нарушения с его стороны срока исполнения поручения налогоплательщика (плательщика сбора) или налогового агента, местной администрации или организации федеральной почтовой связи о перечислении налога (сбора), авансового платежа, пеней. Штраф равен 1/150 ставки рефинансирования за каждый календарный день просрочки.
Таким образом, налогоплательщикам, плательщикам страховых взносов надо учесть в своем налоговом планировании указанное повышение с 01.01.2016 ставки рефинансирования.